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La tercera parte de Robotech empieza un año despues del fin de la guerra contra los Maestros, en el 2033. Al final de esta guerra la Flor de la Vida habia sido liberada de la Matriz de la Protocultura debido a que Zor estrell� la nave de los Maestros contra las ruinas del SDF-1. Entonces las esporas de la Flor de la Vida se expandieron por todo el planeta, por lo que el Sensor N�bula de los Invid pudo detectarla y venir a la Tierra al mando de la Regis.
El Ej�rcito de la Cruz del Sur, debilitado por la guerra contra los Maestros, nada pudo hacer para impedir que los Invid invadieran la Tierra y convirtieran a los sobrevivientes en esclavos. Los invasores se establecieron y formaron colmenas en todo el mundo, siendo la principal la que se encuentra cerca de las ruinas del SDF-1 -llamada Punto Reflex- en Norteam�rica. La resistencia s�lo se conoce en peque�os grupos, quedan muy pocas ciudades intactas y la mayor�a de los poblados est�n habitados por gente que no quiere provocar la ira de los Invid.
Un a�o mas tarde, un grupo de la Fuerza Expedicionaria Robotech, la Divisi�n Marte, llega a reclamar la Tierra. Pero el ataque fracasa estrepitosamente y las naves son destruidas por los incontables mechas Invids aun antes de entrar a la atm�sfera. De este grupo, s�lo un teniente de nombre Scott Bernard logra llegar al planeta. Al ser el �nico sobreviviente y al haber perdido a su prometida Marlene Rush en el ataque, Scott tiene una sola meta en su vida: llegar al cuartel general de los Invid, y esperar refuerzos para un ataque masivo. En el camino conoce a varios otros combatientes, con quienes vivir� varias aventuras en el largo camino desde Argentina a Punto Reflex.